Sinopse: Quando a recém-eleita presidente do conselho estudantil Medaka Kurokami tem uma idéia para uma caixa de sugestões onde as pessoas podem apresentar problemas que precisam de ver resolvidos, ela espera coisas como resgatar filhotes perdidos e dar conselhos. No entanto o que ela e sua melhor amiga Zenkichi encontram em vez disso, são os primeiros sinais de um segredo inacreditável de sua escola. O que parecia um inocente passatempo torna-se num jogo perigoso, em que Medaka e seus amigos do conselho estudantil vão descobrir-se a si mesmos e suas inesperadas habilidades é então que as coisas ficam fora de controlo.